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=== Diversité taxonomique ===

On utilise souvent pour déterminer cette diversité, l’indice de [[Indice de Shannon|Shannon-Wiener]] (H’) qui tient en compte à la fois du nombre de taxons présents et du nombre d’individus de retrouvés dans chaque taxon. On mesure ainsi l’abondance et la régularité de la distribution de chaque taxon.
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:<math>H^\prime = -\sum_{i=1}^S p_i \ln p_i</math>
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<math>p_i</math> : proportion du ''ième'' taxon sur le nombre total d’organismes
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S : nombre total de taxons dans l’échantillon
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Une valeur élevée de cet indice signifie que tous les taxons sont aussi denses, ce qui correspond à un milieu favorable et non pollué. Alors qu’une valeur faible signifie qu’il règne des conditions de vie difficiles dans le milieu, ce qui permet à peu d’espèces de s’établir et en l’absence de compétition, ces espèces auront tendance à pulluler.