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Foraminifera

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Les Foraminifera, en français les Foraminifères, du latin foramen, « ouverture, trou »[1], sont un embranchement de chromistes, caractérisés par leurs coquilles, leurs tests, le plus souvent calcaires et en général multiloculaires (formées de plusieurs loges ou chambres) qui restent en communication entre elles par leurs ouvertures successives (ces perforations dans les parois de séparation des chambres étant appelées foramen). Ce sont des protistes (eucaryotes unicellulaires) extrêmement abondants depuis plusieurs centaines de millions d'années, ce qui leur confère une grande importance au niveau écologique mais aussi scientifique (notamment du fait qu'ils forment un des groupes de fossiles les plus abondants et diversifiés)[2]. Cette microfaune sténohaline colonise majoritairement les fonds marins (foraminifères benthiques) ; une plus faible fraction, les Globigérines (en), est moins diversifiée (foraminifères planctoniques vivant généralement à faible profondeur dans la couche euphotique).

Description

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Foraminifères benthiques (vue ventrale).
Globigerina bulloides, un foraminifère planctonique.

Les foraminifères sont des eucaryotes unicellulaires apparus au Cambrien inférieur (540 Ma), qui se sont surtout développés à partir du Trias.

Leur coquille minérale est appelée « test »[2] (du latin testa, « récipient arrondi », qui a donné « tête ») ; elle comprend une ou plusieurs chambres[3] (ou loculus ou loges) reliées entre elles, et est munie d'un ou plusieurs orifices (« foramen ») qui relient ces loges au milieu extérieur. De ces foramens sortent des pseudopodes[4], qui permettent à l'organisme d'interagir avec son environnement : préhension, alimentation, déplacement.

Le test est initialement composé de matière organique progressivement minéralisée, mais aussi parfois de particules exogènes agglomérées (notamment chez les espèces vivant dans le sédiment ou en profondeur). Celui-ci peut être de type agglutiné (agglomérat exogène), microgranuleux (à grains de calcite), porcelané (calcitique lisse) ou hyalin (cristallin). Les foraminifères se développent en construisant de nouvelles loges à leur test. Celles-ci sont disposées selon une géométrie propre à chaque espèce : elles peuvent être rectilignes, arquées, enroulées ou encore cycliques, et à chaque fois unisériées ou multisériées. Ces agencements peuvent aussi être mixtes, ou encore plus complexes. Les miliolidés ont une disposition particulière, dite « pelotonnée ». La surface du test peut être lisse ou recouverte de stries, de côtes, d'un réticule, de tubercules, de piquants...

Leur taille varie généralement de 38 µm à 1 mm (certains peuvent faire quelques centimètres, avec un maximum enregistré à 18 cm)[5]. On en recense actuellement près de 50 000 espèces, cette famille renfermant des espèces vivantes (6 700–10 000)[6],[7] et fossiles (40 000)[6],[8], ce qui est sans doute peu comparé à la diversité effective, les océans renfermant de nombreuses espèces inconnues de foraminifères planctoniques.

Représentation d'un glaucophyte
  1. Test
  2. Proloculus (chambre initiale)
  3. Chambres
  4. Foramen (ouverture âgée)
  5. Endoplasme
  6. Globule lipide
  7. Phycobilisome
  8. Nucléole
  9. Noyau
  10. Réticulum endoplasmique lisse
  11. Lamelle antérieure
  12. Mitochondrie
  13. Lamelles annulaires naissantes
  14. Appareil de Golgi
  15. Vacuole digestif
  16. Peroxysome
  17. Vacuole phagocytaire
  18. Lysosome
  19. Vésicule de substance adhésive
  20. Ouverture
  21. Ectoplasme
  22. Réticulopodes
  23. Granulés adhésifs
  24. Proie

Écologie et comportement

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Alimentation

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Leur régime alimentaire est constitué de bactéries, d'algues, de larves (de mollusques, d'échinodermes ou de crustacés), et de déchets variés : ils s'adaptent à leur environnement.

Reproduction et croissance

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Les foraminifères ont un cycle de reproduction complexe, appelé « haplo-diplophasique » : il y a alternance d'une génération mononucléée haploïde (gamogonie) et d'une génération diploïde plurinucléée (schizogonie). La phase sexuée (gamogonie) est cependant absente chez certaines espèces.

Chaque foraminifère commence sa vie dans une loge simple (test uniloculaire), qui va se complexifier ou se multiplier avec la croissance. Chaque nouvelle loge ajoutée est plus grande que la précédente, et certaines espèces peuvent ainsi mesurer plusieurs centimètres à partir d'un certain âge, tout en demeurant unicellulaires.

Formation de reliefs

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En milieu de récifs, certains foraminifères actuels ont un comportement encroûtant[n 1], pouvant atteindre tout au plus une épaisseur de 1 cm, sur des surfaces limitées ; ils contribuent très peu à la formation du récif qui est également formé d'encroûtements d'algues[9]. Un genre diffère : le Solenomeris (es), qui pendant l'Ilerdien a formé des récifs depuis le nord de l'Espagne jusqu'au Corbières[10] (Solenomeris ogormani Massieux, 1973)[9]). Il était pour cette raison classé dans les algues rouges corallines (calcaires)[11] jusqu'à ce que son appartenance aux foraminifères soit introduite par Maslov, qui observe en 1956[12] que la morphologie des loges de Solenomeris est semblable à celle des chambres latérales des Orbitoïdidés (es) (Discocyclines (es))[9].

Habitat et répartition

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Les foraminifères sont des êtres absolument ubiquitaires en eau salée et parfois douce : on en rencontre dans toutes les mers du globe, à toutes les profondeurs et à toutes les distances des côtes, et ce depuis des centaines de millions d'années. Ils ont un mode de vie soit benthique (vivant sur ou dans le sédiment, sur le fond des lagunes et des mers) soit planctonique (en suspension dans la colonne d'eau, et particulièrement dans la zone photique mais parfois jusqu'aux abysses). D'une manière générale, les espèces à test porcelané vivent surtout dans les eaux superficielles, et celles à test hyalin sont répandues partout sauf aux très grandes profondeurs. Les espèces à test agglutiné, également ubiquistes, sont les seules qui subsistent au-dessous de 4 000 à 5 000 m. Les espèces qui vivent dans les milieux troublés (courant, prédateurs) développent des tests plus solides. Certaines espèces sont fouisseuses et se nourrissent en creusant le sédiment superficiel (elles sont rares au-delà de 15 cm). Les espèces planctoniques sont équipées de flotteurs, sous la forme de poches de gaz ou de graisse ; elles sont généralement rondes (comme les globigérines) et parfois équipées de piquants, surtout celles vivant près de la surface.

Depuis le Trias, les foraminifères sont tellement abondants qu'ils constituent une composante majeure du sédiment marin.

Histoire de leur découverte

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Planche d'un ouvrage de d'Orbigny représentant des Foraminifères.

C'est en 1825 qu'Alcide Dessalines d'Orbigny (1802-1857) crée l'ordre des foraminifères dans un travail intitulé Tableau méthodique de la classe des céphalopodes. Au cours de sa vie, Orbigny va décrire 1 500 espèces, la plupart nouvelles pour la science. Il fut le premier à étudier leur mode de vie et leurs exigences écologiques. Mais la nature unicellulaire des foraminifères a été découverte par Félix Dujardin (1801-1860) en 1835. C'est grâce à leur étude qu'il découvre le protoplasme des organismes unicellulaires.

Les bases de la classification

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La composition de ce test (organique, agglutiné, carbonaté et siliceux) est le principal critère de classification des foraminifères et est à la base de la plupart des classifications, dont celle de Loeblich et Tappan (1964 et 1988). Les foraminifères à tests organiques sont principalement représentés par des foraminifères unicellulaires, les Allogromiina (sous-ordre). Ce sous-ordre est encore mal connu puisque, du fait de sa perte dans les assemblages fossiles, les micropaléontologues les ont très peu étudiés. Toutefois, actuellement, le groupe Gooday, à Southampton (Royaume-Uni), tente de combler le retard, tout au moins, sur leur reconnaissance. Les foraminifères à tests agglutinés sont caractérisés par l'agglutinat de grains prélevés dans le sédiment (cf. Gaudryina sp., foraminifère en bas à gauche sur la planche proposée). Une sélection des grains pourrait s'opérer chez certaines espèces (par exemple Saccammina micaceus, qui présente uniquement des grains de mica). Deux types de foraminifères à tests carbonatés peuvent être différenciés. Les porcelanés ont un aspect blanc opaque, alors que les hyalins sont transparents et vitreux. Enfin, les foraminifères à tests siliceux sont extrêmement rares. Le deuxième critère de classification est l'agencement des loges. Ainsi, on peut distinguer plusieurs grands types de tests :

  • tests uniloculaires ;
  • tests pluriloculaires :
    • tests sériés, les loges s'organisent en série (e.g. Gaudryina sp.) ;
    • tests spiralés (à la façon des escargots ; les trois autres exemples sur la planche) ;
    • tests discoïdes ;
    • tests milioliformes. Les loges se forment successivement et individuellement dans plusieurs plans ;
    • tests complexes.

Un troisième critère est l'ornementation du test. Le test peut être lisse, mais présente souvent des excroissances (côtes, épines, ponts suturaux...) et des dépressions. Enfin, un quatrième critère est la morphologie de l'ouverture principale et sa position. Ainsi, l'ouverture est parfois en relation avec des éléments supplémentaires (dents, lèvres, plaques...) et/ou à l'extrémité d'un col.

Microfossiles de sédiments marins contenant des radiolaires (sphères), des spicules d'éponges (petites « épines »), des foraminifères planctoniques (petits coquillages blancs) et des foraminifères benthiques (grand coquillage blanc au centre de l'image, ainsi que les petits coquillages jaunes constitués de grains de sable agglomérés). Le diamètre moyen des sphères est d'environ 0,5 mm. Échantillon provenant de sédiments lavés et tamisés à 125 µm (est de la mer de Weddell, Antarctique).

Utilisation potentielle des foraminifères récents

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Omniprésents dans les milieux marins, ils occupent de très nombreuses niches écologiques (des marais maritimes aux plaines abyssales). Du fait de leur cycle de vie court (1 à 3 mois en moyenne, 1 an maximum), les foraminifères réagissent rapidement aux changements de leur environnement. Leurs populations peuvent croître ou diminuer, leur variété se transformer, les loges grandir ou se réduire... La pollution et les changements environnementaux (e.g. variations climatiques) peuvent ainsi conduire à une transformation radicale des populations de foraminifères. Ainsi, leur cycle de vie court et leur ubiquité dans le milieu marin, associés à une grande richesse dans le sédiment (analyses statistiques robustes), une méthode d'analyse peu onéreuse et aisée et à une trace dans le fossile (permet l'étude avant modification du milieu) font des foraminifères, en particulier benthiques, de bons bio-indicateurs de la qualité de l'environnement ou proxies des changements environnementaux.


Les foraminifères en paléontologie

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Biostratigraphie

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Les foraminifères benthiques sont d'excellents marqueurs biostratigraphiques. Ces fossiles stratigraphiques sont utilisés en géologie pour la datation relative des roches sédimentaires.
Certaines roches sont composées principalement d'une accumulation de foraminifères (pierre à liards du Lutécien de Paris, composée de nummulites ; sable de Villiers-Saint-Frédéric (Yvelines) composé de milioles de 1 à 2 mm accumulées par le vent ; etc.).

L'ordre des foraminifères (Foraminifera) est apparu dès le début du Cambrien. Les foraminifères se distinguent par leur architecture (forme et arrangement des chambres), et la microstructure de leur test (organique, agglutination de particules exogènes, cristallisation microgranulaire, porcelanée, ou hyaline, de carbonate de calcium).

Paléoclimats

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De nombreuses espèces de foraminifères forment des tests qui reflètent les conditions environnementale dans lesquels ils ont calcifié. La composition chimique et isotopique des foraminifères calcaires fossilisés permet de déduire les propriétés de l'eau de mer à l'instant où les foraminifères se sont formés. Ainsi, ils constituent un important outil paléoclimatologique[13],[14].

Quelques données sur leur classification

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Ammonia beccarii, un foraminifère benthique de la Mer du Nord.
Heterostegina depressa (Largeur de champ = 4,4 mm).
Miniacina miniacea, des foraminifères benthiques.

Classification selon World Register of Marine Species (2 mai 2022)[15] :

Quelques sous-ordres (-ina), superfamilles (-acea) et familles (-idae) de foraminifères communs :

Notes et références

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  1. Encroûtant : le Larousse en ligne le définit ainsi :

    « Se dit des organismes animaux ou végétaux qui s'étalent en croûte à la surface de leurs supports (algues, éponges, cnidaires, ascidies). [Les lichens encroûtants sont dits crustacés.] »

    — « encroûtant », sur larousse.fr (consulté en ).

Références

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  1. « Foraminifères », définition, sur cnrtl.fr, CNTRL (consulté en ).
  2. a et b Les foraminifères : marqueurs du climat, dossier IFREMER sur svt-monde.org.
  3. « Les foraminifères »(Archive.orgWikiwixArchive.isGoogleQue faire ?), sur geologie.mnhn.fr.
  4. « Rhizopodes », sur ecosociosystemes.fr (consulté en ).
  5. (en) « What are foraminifera », sur bprc.osu.edu (consulté en ).
  6. a et b (en) J. Pawlowski, F. Lejzerowicz, P. Esling, « Next-Generation Environmental Diversity Surveys of Foraminifera: Preparing the Future », The Biological Bulletin, vol. 227, no 2,‎ , p. 93–106 (DOI 10.1086/BBLv227n2p93).
  7. (en) Sina M. Ald, « Diversity, Nomenclature, and Taxonomy of Protists », Syst. Biol., vol. 56, no 4,‎ , p. 684–689 (DOI 10.1080/10635150701494127).
  8. (en) « The World Foraminifera Database », sur marinespecies.org (consulté le ).
  9. a b et c [Perrin 1987] Christine Perrin, « Solenomeris : un Foraminifère Acervulinidae constructeur de récifs », Revue de Micropaléontologie, vol. 30, no 3,‎ , p. 197-206 (résumé, lire en ligne [PDF] sur researchgate.net, consulté en ), p. 198.
  10. Perrin 1987, p. 197.
  11. [Bassi 2003] (en) Davide Bassi, « Reassessment of Solenomeris afonensis Maslov, 1956 (Foraminifera): formerly considered a coralline red alga », Revista Española de Micropaleontología, Instituto Geológico y Minero de España, Université de Ferrara, vol. 35, no 3,‎ , p. 357-363 (ISSN 0556-655X, lire en ligne [sur researchgate.net], consulté en ).
  12. [Maslov 1956] (ru) V.P. Maslov, « Iskopaemye izwest kovye vodorosli SSSR » [« Algues calcaires fossiles de l'URSS »], Trudy Instituta Geologicheskikh Nauk, Akademiya Nauk SSSR, vol. 60,‎ , p. 1-301. Cité dans Perrin 1987, p. 198.
  13. (en) « Foraminifera and environment », dans « Research » > « Ocean Circulation and Climate Dynamics » > « Paleo-Oceanography » > « Research Topics » > « Proxies », sur geomar.de, GEOMAR - Helmholtz Centre for Ocean Research Kiel (consulté en ).
  14. [Kucera 2007] (en) Michal Kucera, chap. 6 « Planktonic Foraminifera as Tracers of Past Oceanic Environments », dans Developments in Marine Geology, vol. 1, Elsevier, , sur linkinghub.elsevier.com (ISBN 978-0-444-52755-4, DOI 10.1016/s1572-5480(07)01011-1, lire en ligne), p. 213–262.
  15. World Register of Marine Species, consulté le 2 mai 2022

Références taxonomiques

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Sur les autres projets Wikimedia :

Bibliographie

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  • [Vénec-Peyré 2005] Marie-Thérèse Vénec-Peyré, Les Planches inédites de foraminifères d'Alcide d'Orbigny À l'aube de la micropaléontologie, Publications scientifiques du Muséum National d'Histoire Naturelle, coll. « Des Planches et des Mots », , 302 p. (présentation en ligne).
  • [Bé 1977] (en) A.W.H. , « An ecological, zoographic and taxonomic review of recent planktonic foraminifera », dans Anthony (Thomas Stanley) Ramsay (dir.), Oceanic micropaleontology, vol. 1, Londres, éd. Academic press, Backhuys Publishers, , 1490 p. (présentation en ligne).
  • [Berthois & Le Calvez 1960] Léopold Berthois et Yolande Le Calvez, « Étude de la vitesse de chute des coquilles de foraminifères planctoniques dans un fluide comparativement à celle des grains de quartz », Revue des Travaux de l'Institut des Pêches Maritimes, vol. 24, no 2,‎ , p. 293-301 (lire en ligne [sur archimer.ifremer.fr], consulté en ).
  • [Holbourn, Henderson & MacLeod 2013] (en) Ann Holbourn, Andrew S. Henderson et Norman MacLeod, Atlas of benthic foraminifera, Wiley-Blackwell / Natural History Museum, , 645 p. (présentation en ligne).

Radiothèque

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Liens externes

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