UBTF: различия между версиями

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
[отпатрулированная версия][отпатрулированная версия]
Содержимое удалено Содержимое добавлено
Нет описания правки
Нет описания правки
Строка 45: Строка 45:
== Ген и изоформы ==
== Ген и изоформы ==
Ген ''UBTF'' у человека находится на 17-ой хромосоме в локусе 17q21.31 и содержит 25 экзонов. Известен ряд изоформ белка UBTF, которые образуются из-за альтернативного сплайсинга первичных транскриптов гена ''UBTF''. Псевдогены этого гена располагаются на коротких плечах хромосом 3, 11 и Х, а также длинном плече хромосомы 11<ref name="ncbi" />.
Ген ''UBTF'' у человека находится на 17-ой хромосоме в локусе 17q21.31 и содержит 25 экзонов. Известен ряд изоформ белка UBTF, которые образуются из-за альтернативного сплайсинга первичных транскриптов гена ''UBTF''. Псевдогены этого гена располагаются на коротких плечах хромосом 3, 11 и Х, а также длинном плече хромосомы 11<ref name="ncbi" />.

== Внутриклеточная локализация ==
UBTF — ядрышковый белок. Он обнаруживается в двух ядрышковых компонентах — плотном фибриллярном компоненте и фибриллярных центрах. На клетках HeLa было показано, что ядрышковая локализация UBTF связана с интенсивностью транскрипции генов рРНК (рДНК). В ядрышках, имеющих единственный крупный фибриллярный центр (такие ядрышки характеризуются низким уровнем транскрипции рДНК), UBTF располагается преимущественно там. Однако в ядрышках, характеризующихся интенсивной транскрипцией рДНК и и имеющих множество мелких фибриллярных центров, UBTF локализуется в основном на границе фибриллярных центров и плотного фибриллярного компонента<ref>{{cite pmid|19393134}}</ref>.


== Примечания ==
== Примечания ==

Версия от 09:01, 26 апреля 2016

Локус: Локус 17q21.31

UBTF
Изображение из PDB (1k99).Изображение из PDB (1k99).
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
Символ UBTF ; NOR-90; UBF; UBF-1; UBF1; UBF2
Внешние ID OMIM: 600673 MGI98512 HomoloGene7970 GeneCards: Ген UBTF
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7343 21429
Ensembl ENSG00000108312 ENSMUSG00000020923
UniProt P17480 A2AWT5
RefSeq (мРНК) NM_001076683 NM_001044383
RefSeq (белок) NP_001070151 NP_001037848
Локус (UCSC) Chr 17:
44.21 – 44.22 Mb
Chr 11:
102.3 – 102.32 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

UBTF (англ. upstream binding transcription factor, RNA polymerase I, другие названия UBF; UBF1; UBF2; UBF-1; NOR-90) — ядрышковый транскрипционный фактор, регулирующий транскрипцию генов рРНК РНК-полимеразой I. Он также участвует в процессинге пре-рРНК. У человека кодируется геном UBTF, расположенным на 17-ой хромосоме[1].

Ген и изоформы

Ген UBTF у человека находится на 17-ой хромосоме в локусе 17q21.31 и содержит 25 экзонов. Известен ряд изоформ белка UBTF, которые образуются из-за альтернативного сплайсинга первичных транскриптов гена UBTF. Псевдогены этого гена располагаются на коротких плечах хромосом 3, 11 и Х, а также длинном плече хромосомы 11[1].

Внутриклеточная локализация

UBTF — ядрышковый белок. Он обнаруживается в двух ядрышковых компонентах — плотном фибриллярном компоненте и фибриллярных центрах. На клетках HeLa было показано, что ядрышковая локализация UBTF связана с интенсивностью транскрипции генов рРНК (рДНК). В ядрышках, имеющих единственный крупный фибриллярный центр (такие ядрышки характеризуются низким уровнем транскрипции рДНК), UBTF располагается преимущественно там. Однако в ядрышках, характеризующихся интенсивной транскрипцией рДНК и и имеющих множество мелких фибриллярных центров, UBTF локализуется в основном на границе фибриллярных центров и плотного фибриллярного компонента[2].

Примечания

  1. 1 2 UBTF upstream binding transcription factor, RNA polymerase I [ Homo sapiens (human) ].
  2. He J., Wu X., Tao W. Nucleolar localization of upstream binding factor in HeLa cells depends on rRNA synthesis activities. (англ.) // Folia biologica. — 2008. — Vol. 54, no. 6. — P. 202—206. — PMID 19393134. [исправить]