Providencia heimbachae: NCTC12003_02317
Help
Entry
NCTC12003_02317 CDS
T05509
Name
(GenBank) sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C
KO
K26063
(R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase [EC:1.1.-.-]
Organism
phei
Providencia heimbachae
Pathway
phei00310
Lysine degradation
phei01100
Metabolic pathways
phei01120
Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
phei00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00310 Lysine degradation
NCTC12003_02317
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FAD-oxidase_C
FAD_binding_4
Fer4_8
Fer4_20
Fer4_18
BBE
Fer4_10
Fer4_17
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
SQH13589
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(2568695..2571748)
Genome browser
AA seq
1017 aa
AA seq
DB search
MIPRISEAPHLNKLVIEFIHELQEQGFTGDNGTSYAERLSMATDNSIYQLLPQAIVFPRS
SADVQILTRVAGQKKYRTLSFTPRGGGTGTNGQSLTEGIVVDMSRYMNRILEINPEQGWV
KVEAGVIKDQLNQFLKPYGYFFSPELSTSNRATLGGMINTDASGQGSLVYGKTSDHVLGV
KAMVLGGECIDTRSMPVELAQTIASEDSVVGRIYKTVLERCLEQRPLIEEKFPKLNRFLT
GYDLRHVFNDALTEFDLTRILTGSEGSLAFITEATLDITPLPKARRLVNVKYDSFESALR
NAPFMVNAKALSVETVDSKVLNLAREDIVWHSVKSLITDVPNKEMLGLNIVEFSGDDVVE
IDRLMDNLCQQLDELMANNYAGIIGYQTCNDLDDITRIYNMRKKAVGLLGNSKGAAKPIP
FVEDTCVPPEHLADYIVEFRALLDSHQLNYGMFGHVDAGVLHVRPALDMCDPQQEILMKQ
ISDEIVALTAKYGGLLWGEHGKGFRAQYSPEFFGEVLYGELRNIKAAFDPDNRLNPGKIC
PPAGIDAPMKQVDDIKRGTFDRQIPIQMRQEFRGAMDCNGNGLCFNFDVKSPMCPSMKIS
GQRIHSPKGRATLVREWLRLLAEQGVTPENIEKGIRDNKPSLRGLIDKTRNSWKAKQGDY
DFSHEVKASMAGCLACKACSTQCPIKIDVPSFRAKFLALYHGRYLRPIRDHIVANVEASA
PLLSKVPSVFNFFLRQPLVQKLSERTIGMVDLPLFSEPTLKQELLGHSATEVTLEQLEGM
SPSLRENYVLVVQDPFTSYYDAKVVADFIRLIEKLGYKPVLLPFSPNGKAQHIKGFLARF
AKTASKTADFLNRVAKLQLPMVGVDPALVLCYRDEYHEILGEDQCKFTVMLAHEWLITLP
DPQKLNEISQQPWYFFGHCTESTALPNSGNQWSALFARYGQKLTNVSVGCCGMAGTYGHE
VVNIENSKGIYNLSWQPAMSALPKERCLSSGYSCRSQVKRMENTIIKHPIQALLEIV
NT seq
3054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccgcgtatatcagaagcacctcatctcaataaattagtcattgaattcatacac
gagctgcaagagcaaggctttacgggtgataatggcacaagctatgctgagcgcttatca
atggcgacagataatagtatttatcaattattacctcaagccattgtttttcctcgttct
agtgcagacgtacaaattcttacccgcgttgcagggcaaaaaaagtaccgtacactaagc
tttactccgagagggggcgggacgggaactaacggacaatccttaacggaagggattgtg
gttgatatgtctcgttatatgaaccgtattctagagataaacccagaacaagggtgggta
aaagttgaagcgggcgtgattaaagatcagcttaatcagttcttaaaaccgtatggctat
tttttctcacctgaattatccaccagtaatcgcgcgactttgggtggaatgattaatacg
gatgcttctggacaaggttccttagtgtatggaaaaacctcggatcatgtactgggtgtc
aaagcgatggtacttggaggggaatgcattgatacccgatcaatgcctgttgaacttgcc
caaacgattgcgtcagaagattcggtggtaggaaggatctacaaaacagtattagaacgc
tgccttgaacagcgccccttgattgaagaaaaatttcctaaattaaaccgttttcttacg
ggttatgatttacgccatgtatttaatgacgctttgacagagtttgacttaacgcggatc
ttgaccggttctgaagggtcgctggcttttattaccgaagcgacgcttgatatcacacca
ttacccaaagcacgtcgactggtgaatgtgaagtatgattcattcgaatctgcgttacgt
aatgcgccttttatggtgaatgcgaaagcattatcggttgagaccgtcgactcaaaagta
ttaaatttagcacgggaagatattgtctggcattcagtaaaatcattgattaccgatgtc
cctaataaagaaatgttagggctgaatattgttgaatttagtggtgatgatgtcgttgaa
attgaccgtttaatggataatttgtgccagcagcttgatgagcttatggcaaataattac
gccggtataatcggttaccaaacgtgtaatgacctcgatgatattacgcgtatttataat
atgcgcaaaaaagcggtgggattattaggtaacagtaaaggtgcggcaaaaccgatccca
tttgtagaagatacttgtgtgcctccggaacatctggcggattatattgtagaatttagg
gcgttacttgatagccatcagctgaattatggcatgtttggacatgtggatgcgggggta
ttacatgttcgacccgctctcgatatgtgcgatccacaacaagaaattttaatgaaacaa
atttcggatgaaattgttgcattaacagctaaatatggcggacttttgtggggagagcac
gggaaaggttttagagcgcaatacagtccagaattttttggtgaagtgctttatggtgaa
cttcgtaatattaaagctgcctttgacccagataaccgtttaaatcccggcaaaatttgc
cctccggcaggtattgatgcaccaatgaagcaggttgatgacatcaaacgaggcactttt
gataggcaaattcctatccaaatgcgccaagaatttcgtggtgcgatggactgtaacggc
aatggcctatgttttaactttgatgttaaaagcccaatgtgcccatcaatgaaaataagc
gggcagcgtatccattcaccgaaagggcgtgcaacgcttgtacgtgagtggttaaggtta
ttagcggaacaaggtgttacccctgaaaatattgaaaagggaataagagataacaaacca
tctttacgtggattgattgataaaacacgtaattcctggaaagccaaacaaggggattac
gacttttctcatgaagttaaagcctcaatggcaggttgtttagcctgtaaggcttgctcc
acacaatgcccgattaaaatcgatgtaccttccttcagagccaaattcttagcgttatat
catggacgctatttaagaccgattcgagaccatattgtggccaatgtagaggcaagtgcg
ccgttactttctaaagtacctagcgtatttaacttctttttacgccagccgttagtgcaa
aaactcagtgagcgaaccattggcatggtcgatttacctttattttccgagccaacgtta
aaacaagaacttttaggtcattcagccacagaagtcacacttgaacagctcgaaggaatg
agtccatccctgcgggaaaattatgttttagttgttcaagaccctttcaccagttattac
gatgctaaagtcgtggctgacttcattcgattaatcgaaaaactaggctataaacccgtt
ttattacctttttcgccaaatggaaaagcgcaacatattaaagggttcctggctcgattt
gcaaaaacagccagtaaaacggccgattttttaaatcgtgtggcaaaattgcagttacca
atggttggtgttgaccctgcattagtgctctgttatcgcgatgaatatcatgagatttta
ggcgaagatcaatgtaagtttaccgttatgctagctcatgaatggttaattacgctaccg
gatccacagaaattaaatgagataagccaacaaccttggtatttcttcggccattgcact
gaatctaccgcactgccaaatagcggcaaccaatggtcagcactatttgcgcgctatgga
caaaaattaaccaatgtgagtgtgggatgttgtggcatggcaggcacttatggtcatgaa
gtggtgaatatcgaaaattcaaaaggcatctataatctatcgtggcaacccgcgatgagc
gcgctaccgaaagagcgttgtcttagttctggttattcgtgtcgtagccaagtgaaacgc
atggaaaacacaataataaaacacccaattcaagcattgctggagatcgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system