SETDB1

SET domain, bifurcated 1
Estructuras disponibles
PDB	Buscar ortólogos: PDBe, RCSB Lista de códigos PDB 3DLM Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Símbolos	SETDB1 (HGNC: 10761) ESET, KG1T, KIAA0067
Identificadores; externos	OMIM: 604396 ; HomoloGene: 32157 ; EBI: SETDB1; GeneCards: Gen SETDB1; UniProt: SETDB1; Bases de datos de enzimas IntEnz: entrada en IntEnz; BRENDA: entrada en BRENDA; ExPASy: NiceZime view; KEGG: entrada en KEEG; PRIAM: perfil PRIAM; ExplorEnz: entrada en ExplorEnz; MetaCyc: vía metabólica
Número EC	2.1.1.43
Locus	Cr. 1 q21.2
	Referencias: AmiGO / QuickGO
Patrón de expresión de ARNm
	Más información
Ortólogos
Humano	Ratón
9869	84505
Véase HS	Véase MM
Q15047	D3YYC3
NM_001145415	NM_001163641
NP_001138887	NP_001157113
Cr. 1:; 150.9 – 150.94 Mb	Cr. 3:; 95.32 – 95.36 Mb
[1] ;	[2]
	v; t; e;
	[editar datos en Wikidata]

La histona-lisina N-metiltransferasa SETDB1 es una enzima codificada en humanos por el gen setdb1.^[1]^[2]

El dominio SET se encuentra altamente conservado y se conforma de una secuencia de aproximadamente 150 aminoácidos implicada en la modulación de la estructura de la cromatina. Fue originalmente identificada como parte de una extensa región conservada presente en la proteína Trithorax de Drosophila y fue posteriormente identificada en las proteínas Su(var)3-9 y Enhancer of zeste de Drosophila, de donde deriva el acrónimo SET. Estudios posteriores han sugerido que el dominio SET podría ser una "firma" de las proteínas que modulan transcripcionalmente los estados activos o reprimidos de la cromatina por medio del reordenamiento de esta.^[2]

Interacciones

La proteína SETDB1 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

TRIM28^[3]

Referencias

↑ Harte PJ, Wu W, Carrasquillo MM, Matera AG (Jun de 1999). «Assignment of a novel bifurcated SET domain gene, SETDB1, to human chromosome band 1q21 by in situ hybridization and radiation hybrids». Cytogenet Cell Genet 84 (1-2): 83-6. PMID 10343109.
↑ ^a ^b «Entrez Gene: SETDB1 SET domain, bifurcated 1».
↑ Schultz, David C; Ayyanathan Kasirajan, Negorev Dmitri, Maul Gerd G, Rauscher Frank J (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (United States) 16 (8): 919-32. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302.

Enlaces externos

MeSH: SETDB1+protein,+human (en inglés)

Datos: Q18034745

[pmid10343109-1] Harte PJ, Wu W, Carrasquillo MM, Matera AG (Jun de 1999). «Assignment of a novel bifurcated SET domain gene, SETDB1, to human chromosome band 1q21 by in situ hybridization and radiation hybrids». Cytogenet Cell Genet 84 (1-2): 83-6. PMID 10343109.

[entrez-2] «Entrez Gene: SETDB1 SET domain, bifurcated 1».

[pmid11959841-3] Schultz, David C; Ayyanathan Kasirajan, Negorev Dmitri, Maul Gerd G, Rauscher Frank J (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (United States) 16 (8): 919-32. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302.

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