Bien avant que le temps n'existe, dans le Néant, se mouvait une entité nommée Nihil. Chaque fois qu'une forme de vie apparaissait, Nihil la dévorait, cherchant à rester la seule existence. Ensuite, elle s'endormait, jusqu'au jour où les Déesses d'Or — Farore, Nayru et Din — décidèrent de mettre fin à cette situation. Elles créèrent l'Univers par-dessus le Néant pour sceller Nihil. Après la formation du monde d'Hyrule, Nihil tenta de percer le sceau en créant des failles un peu partout, dans l'espoir de rétablir le chaos originel. Pour contrer cette menace, les Déesses d'Or envoyèrent les Tris, des fées magiques liées à la Triforce, capables de refermer les failles. Une fois leur mission accomplie — celle de maintenir la stabilité de l'espace-temps —, elles retournèrent auprès des Déesses créatrices.
Mais, des millénaires plus tard, de mystérieuses fissures ont surgi à travers Hyrule, provoquant la disparition de ses résidents, y compris de Link : maintenant, c'est à la princesse Zelda de sauver son royaume. Zelda fait ainsi la rencontre de la fée Tri, qui lui offre un sceptre magique lui permettant de générer des copies, nommées échos, de divers objets[2],[3]. Zelda peut aussi jeter des objets sur ses ennemis.
Le jeu se vend à plus de 200 000 unités pour sa première semaine de commercialisation au Japon, en tête du classement des ventes de jeux toutes consoles confondues, selon les données recueillies par Famitsu[12].