ウッズホール海洋研究所(ウッズホールかいようけんきゅうじょ、英語: Woods Hole Oceanographic Institution、略称: WHOI)は、アメリカ、マサチューセッツ州に所在する海洋研究施設の複合体で、およそ40ほどの建造物より構成されている。非営利研究法人で、基礎分野から応用海洋学まで幅広く研究スタッフを備えている。