W 1995 roku Matt McKeon ukończył Saint Louis University. Podczas studiów występował w szkolnej drużynie w rozgrywkach uniwersyteckich w klubie St. Louis Billikens.
W 1996 roku został zawodnikiem występującego w nowo utworzonych rozgrywkach Major League Soccer – Kansas City Wizards. W klubie z Kansas grał (z krótką przerwą na roczną grę w Colorado Rapids) do końca kariery do 2002 roku. Łącznie w latach 1996-2002 w MLS rozegrał 172 mecze, których strzelił 13 bramek.
W reprezentacji Stanów Zjednoczonych McKeon zadebiutował 30 lipca1999 roku w meczu z Niemcami, podczas Pucharu Konfederacji 1999, na którym USA zajęły 3. miejsce. Na turnieju w Meksyku wystąpił w meczu o trzecie miejsce z Arabią Saudyjską. Ten drugi mecz był zarazem ostatnim McKeona w reprezentacji. W spotkaniu tym został ukarany czerwoną kartką.