Андреас Эггерт начинал профессиональную карьеру в составе клуба Воель. В течение 8 лет играл за разные Датские клубы Брабранд, Воель/Силькеборг, ГОГ. В 2006 году немецкий клуб Фленсбург-Хандевитт заключил с Андреасом Эггертом контракт. В Фленсубрге он провёл 2 сезона, где в чемпионате Германии сыграл 62 матча и забил 179 голов. В 2008 году Андреас Эггерт заключает контракт с клубом Скьерн, в котором он проводит один сезон. В 2009 году Андреас Эггерт возвращается в Фленсбург-Хандевитт, где в 2014 году он выиграл Лигу чемпионов ЕГФ. В 2016 году стало известно, что Андерс Эггерт с сезона 2017/18 станет игроком Скьерна[2][3][4]
Международная
Андреас Эггерт играл за сборную Дании по гандболу. В составе сборной Дании Андреас Эггерт сыграл 160 матчей и забил 581 гол.