CDH22

CDH22
Ідентифікатори
Символи	CDH22, C20orf25, dJ998H6.1, cadherin 22
Зовнішні ІД	OMIM: 609920 MGI: 1341843 HomoloGene: 23148 GeneCards: CDH22
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • зв'язування з іоном металу • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell surface • catenin complex Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • brain development • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • cell-cell junction assembly • adherens junction organization • cell-cell adhesion mediated by cadherin • cell-cell adhesion • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64405	104010
Ensembl	ENSG00000149654	ENSMUSG00000053166
UniProt	Q9UJ99	Q9WTP5
RefSeq (мРНК)	NM_021248	NM_174988
RefSeq (білок)	NP_067071	NP_778153
Локус (UCSC)	Хр. 20: 46.17 – 46.31 Mb	Хр. 2: 164.95 – 165.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH22 (англ. Cadherin 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 828 амінокислот, а молекулярна маса — 89 091.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRPRPEGRGL		RAGVALSPAL		LLLLLLPPPP		TLLGRLWAAG		TPSPSAPGAR
QDGALGAGRV		KRGWVWNQFF		VVEEYTGTEP		LYVGKIHSDS		DEGDGAIKYT
ISGEGAGTIF		LIDELTGDIH		AMERLDREQK		TFYTLRAQAR		DRATNRLLEP
ESEFIIKVQD		INDSEPRFLH		GPYIGSVAEL		SPTGTSVMQV		MASDADDPTY
GSSARLVYSV		LDGEHHFTVD		PKTGVIRTAV		PDLDRESQER		YEVVIQATDM
AGQLGGLSGS		TTVTIVVTDV		NDNPPRFPQK		MYQFSIQESA		PIGTAVGRVK
AEDSDVGENT		DMTYHLKDES		SSGGDVFKVT		TDSDTQEAII		VVQKRLDFES
QPVHTVILEA		LNKFVDPRFA		DLGTFRDQAI		VRVAVTDVDE		PPEFRPPSGL
LEVQEDAQVG		SLVGVVTARD		PDAANRPVRY		AIDRESDLDQ		IFDIDADTGA
IVTGKGLDRE		TAGWHNITVL		AMEADNHAQL		SRASLRIRIL		DVNDNPPELA
TPYEAAVCED		AKPGQLIQTI		SVVDRDEPQG		GHRFYFRLVP		EAPSNPHFSL
LDIQDNTAAV		HTQHVGFNRQ		EQDVFFLPIL		VVDSGPPTLS		STGTLTIRIC
GCDSSGTIQS		CNTTAFVMAA		SLSPGALIAL		LVCVLILVVL		VLLILTLRRH
HKSHLSSDED		EDMRDNVIKY		NDEGGGEQDT		EAYDMSALRS		LYDFGELKGG
DGGGSAGGGA		GGGSGGGAGS		PPQAHLPSER		HSLPQGPPSP		EPDFSVFRDF
ISRKVALADG		DLSVPPYDAF		QTYAFEGADS		PAASLSSLHS		GSSGSEQDFA
YLSSWGPRFR		PLAALYAGHR		GDDEAQAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20